现阶段，因为敏感度限制，大部分方式必须在标识与分析时对样品开展适度的程序增加，但是也有很多人尝试绕开这一难题，如MosaicTechnologies企业引入的固相PCR方式，引物设计非特异强，无而且免去了液相处理繁琐；LynxTherapeutics企业引入大规模的并行处理固相法(Massivelyparallelsolid-phasecloning)，可在一个样品中并且对不计其数的DNA精彩片段开展，且不用独立和处理分离出来每一个。

cDNA基因百度文库由PCR物质构成，表面醛基修饰方法，为发夹结构构造，长短一般在百余至千余碱基对，因此芯片的混种杂交标准对每一个基因无法保证是好的，假阳性率比较高，表面醛基修饰的原理，因而，上海表面醛基修饰，判断cDNA微阵列的后的结果时，表面醛基修饰处理，必须对挑选出的基因开展测序。在应用cDNA微阵列开展研究时，一般需要提供一个对比样版，把与必须研究的样本给与不同类型的标识，将二者灯亮混匀一同引入芯片开展孵育。扫描仪后所得到的原始记录是每个表格中中网络信号的比例。

2.生物学意义分析

主要指通过分析芯片杂交数据，研究差异表达基因的生物学意义。通常，在芯片中某一或发育时期可能有成千上万个差异表达基因。例如，基因芯片分析植物根部可能有400多个特意表达的基因，如果要将这些基因的来龙去脉都搞清楚，可能要追溯超过4000篇以上的文献(假设1个基因需要查阅10篇文献)。这种不捡重点的方法耗时耗力，所获得的结果也往往没有意义。

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